在医学上，聚丙烯酰胺凝胶可用作非凝血酶原粒化剂，外科，隐形眼镜原料，微胶囊的外层包复料，并用作制造高质量的止血拴，妇女卫生巾及小儿尿布，在医学领域，均聚物凝胶用于非凝血酶原料和药品的载体。交联的部分水解聚丙烯酰胺可用于生化领域，粒度几百微米到几十微米的聚丙烯酰胺可用于色谱填料(例如凝胶色谱柱填料)，可有效地分离细胞色素等球形蛋白质。并能进一步对蛋白质脱盆、浓缩等。聚丙烯酰胺树脂经Mannich反应，在酰胺基侧链上经亚甲基桥引入L-脯氨酸或L-轻脯氨酸，在与铜离子配位，得到手性配体树脂，它对一系列DL氨基酸进行有效拆分。经Hofmann降解得到的聚乙烯胺树脂上手性氨基酸再与铜离子络合，作为配体交换色谱的固定相，可对一系列氨基酸进行拆分，对芳香氨基酸的拆分效果尤佳，由于骨架的亲水性较强，大大缩短了拆分时间。